El Santuario Nacional Histórico de Machupicchu se encuentra sobre una gran estructura de granito orogénicos bautizado por el Dr. Isaías Bowman como el "batolito Vilcapampa" que los afloramientos más de cerca de 400 km ² (154 millas ²). Su formación pertenece en la escala de tiempo geológico al Paleozoico Inferior o primaria, y pueden tener una edad aproximada de 250 millones de años. El batolito Vilcapampa blanco-gris del granito es una roca ígnea intrusiva (magma enfriado en grandes profundidades en el interior de la tierra); se trata principalmente de compuestos en promedio por 60% de feldespato, el 30% de cuarzo, y un 10% de la mica. Granito que ha entrelazado equigranular posee textura y del 6 ° a 7 ° de dureza en la escala de MOHS con una resistencia de 1200 Kg / cm ². Asimismo, en esta región hay otras rocas que corresponde a la del Paleozoico Inferior, como esquistos, cuarcitas y conglomerados metamórficos que podría tener una edad de 350 a 450 millones de años. Machupicchu (como la mayoría de los nombres de los pueblos quechua y diferentes sitios en la región) es una palabra compuesta que proviene de machu = viejo o antiguo, y picchu = cresta o montaña, por lo tanto, Machupicchu se traduce como "Montaña Vieja". La famosa montaña que se ve en frente, y aparece en la mayoría de los clásicos puntos de vista de la página se llama Waynapicchu (Montaña Joven). Lamentablemente el original nombre de los mencionados sectores se han perdido, Machupicchu, Waynapicchu y otros nombres propios utilizados en la actualidad son más contemporáneo; atribuirse probablemente por los agricultores que viven en la región antes de la llegada de Bingham. Sin embargo, de acuerdo a los estudios sobre algunos documentos del siglo XVI, el nombre original de toda la zona podría ser "Picchu".