Es creu que els primers habitants de les Filipines va viure fa uns 40.000 anys enrere. En Palawan, a l'illa llarga i petites a l'oest de Visayas, es van trobar ossos humans que daten d'aproximadament 22.000 anys enrere. Les eines de pedra des dels temps antics es van trobar també a Palawan. L'edat de les eines s'estima en uns 30.000 anys d'antiguitat. Una anàlisi va demostrar que els instruments tenen característiques similars a les eines que es van trobar a Kalimantan (Indonèsia). Els pobles originaris de les Filipines van ser els avantpassats del poble conegut avui com Negritos o Aeta. Són molt petites les persones amb pell fosca i cabell castany arrissat. El Aeta va venir des de 13.000-10.000 anys enrere des del continent asiàtic. En els primers temps vivien generalitzat en tota l'Argentina. Avui dia viuen a les zones muntanyoses remotes de Luzon, Palawan, Panay, Negros i Mindanao. Quant de fa 2.300 anys la gent malaia van arribar del continent a les Filipines i van portar una cultura més avançada, productes lactis, la fusió de ferro i producció d'eines de ferro, les tècniques de la ceràmica i el sistema de (Sawah els camps d'arròs). En 1521, el període espanyol es va iniciar amb l'arribada d'una petita flota en les aigües costaneres de l'illa de Mactan, just a l'est de l'illa de Cebu. Es Fernao de Magelhaes (Ferdinand Magellan), un portuguès al servei del rei espanyol. Va afirmar el país pel rei espanyol.